مقادیر  CT در تست کرونا به شدت با ویروس قابل کشت و احتمال عفونت ارتباط دارد.

خلاصه شواهد

مقادیر CT در تست کرونا به عنوان اندازه گیری بار ویروسی SARS-CoV-2 نشان داد که سطح SARS-CoV-2 RNA در دستگاه تنفسی فوقانی در زمان شروع علامت بیشترین بوده و بطور مرتب در طی 10 روز اول پس از شروع بیماری کاهش یافته است و سپس ثابت شده است.

• در روزهای 2 تا 7 از زمان شروع علائم میانگین هندسی (GM) Ct 28 بود (95٪ CI 27.8 تا 28.6).
• در هفته دوم (روزهای 8 تا 14) ، GM Ct 31 بود (95٪ CI: 9.8 تا 32 ؛ p <0.001 در مقایسه با هفته 1)
• پس از 14 روز ، GM Ct 32 بود (95٪ CI: 31.6-334.5 ؛ p = 0.01 در مقایسه با هفته 1) (تفاوت معنی داری در مقادیر Ct بین روزهای 8-14 و بعد از 14 روز وجود نداشت).

ویروس قابل کشت از 133 (41٪) نمونه (از 111 مورد) جدا شد.

تشخیص ویروس قابل کشت از زمان بروز علائم به اوج خود رسید.

در 246 نمونه از 176 مورد علامت دار، که تاریخ شروع علائم مشخص بود، 103 مورد (42٪) از نظر کشت مثبت بودند؛ به این معنی که 30 نمونه از آنها ویروس کشت شده بدون علامت بودند.

میانگین Ct از همه 324 نمونه 31 بود (دامنه بین چهارقسمی (IQR): 27.5–33.9 ؛ دامنه: 17.5–41.8). 233 مورد (92٪) غیر شدید (بدون علامت یا خفیف تا متوسط) و 20 نفر (8٪) دارای بیماری شدید (نیازمند به پذیرش در بخش مراقبت های ویژه و / یا کشنده) طبقه بندی شدند.

هیچ تفاوتی در مقادیر Ct بین کسانی که بدون علامت بودند (متوسط Ct = 31 ؛ IQR: 28-33) و افرادی که علامت خفیف تا متوسط (میانه Ct = 31 ؛ IQR: 27-35) یا شدید (متوسط Ct = 33 ؛ IQR) 28. – 34) بیماری داشتند (79/0 = p) دیده نشد.

مقایسه طبقه ای موارد شدید با گذشت زمان نتیجه مشابهی را نشان داد.

مقادیر CT در هفته 1 کمتر از هفته 2 بود. هیچ تفاوتی در میزان مثبت بودن کشت از 62 نمونه از 61 مورد بدون علامت وجود نداشت: 21 مورد از 62 نمونه از افراد بدون علامت در مقابل 112 از 262 نمونه از افراد علامت دار (نسبت شانس برآورد شده (OR) = 0.66 ؛ 95٪ CI: 0.34-1.31.

مشابه یافته های Bullard و همکاران و Piralla ، رابطه شدیدی بین مقدار Ct و توانایی بازیابی ویروس عفونی وجود دارد. میزان تخمین زده شده ویروس عفونی در حال بهبودی برای هر واحد افزایش در مقدار Ctr 0.67 کاهش یافت (95٪ CI: 0.58-0.77).

تکثیر ویروس از 5/60 نمونه با Ct> 35 موفقیت آمیز بود. هر پنج نفر از موارد علامت دار بودند و هیچ یک بیماری سختی نداشتند. احتمال تخمین زده شده برای بهبود ویروس از نمونه های دارای Ct> 35 8٪ بود (95٪ CI: 2.8٪ -18٪).

شکل2: رابطه بین مقدار RT-PCR CT و مثبت بودن کشت در تجزیه و تحلیل رگرسیون لجستیک اثرات ، SARS-CoV-2 ، ژانویه-مه 2020 (n = 324)

هنگامی که شروع علائم مبتنی بر یادآوری علائم بود، مدت زمان متوسط ریزش ویروس که توسط کشت اندازه گیری می شود 4 روز بود (IQR: 1-8 ؛ دامنه: 13 تا 12).

میزان مثبت بودن کشت در طول هفته 1 نسبت به هفته 2 به طور قابل توجهی بالاتر بود (74٪ در مقابل 20٪ ؛ p = 0.002).

ده روز پس از بروز علائم، احتمال کشت ویروس به 6.0٪ کاهش یافت (95٪ CI: 0.9-31.2٪). باز هم این مشاهدات با آنچه ما قبلاً می دانستیم مطابقت دارد.

جدول 2 در این مقاله تجزیه و تحلیل بر اساس سن و مثبت بودن 324 مورد را گزارش می کند. از نظر گروه سنی هیچ تفاوتی در میزان مثبت بودن کشت یا مقادیر CT وجود نداشت؛ اگرچه گروه سنی جوان 0-20 سال فقط به اندازه ی 14 مورد در مجموعه داده سهم داشت.

آنها چه کاری انجام دادند؟

این مطالعه آزمایش همبستگی بین نتایج RT PCR و آستانه چرخه (CT) و روز شروع علائم و احتمال کشت زنده SARS CoV-2 را در 324 نمونه از 253 مورد مثبت گزارش کرده است (از مجموعه اصلی 754 نمونه URT از 425 موارد علامت دار که مثبت بودند).

تمام نمونه ها باید مربوط به یک روز روشن از شروع علائم و نمونه برداری باشد. نمونه های آن شامل ترشحات بینی، گلو، ترکیب بینی و گلو، و حلق بود. آسپیرات های حلقی توسط پرسنل یا ترشحات بینی خود شخص نمونه گرفته شده بودند. PCR ژن RNA پلی مراز به نام RdRp را هدف قرار داد. شواهد اثر سیتوپاتیک در سلولهای Vero کشت شده با حضور SARSCoV-2 توسط رنگ آمیزی نوکلئوپروتئین به روش ایمونواسی آنزیم بر روی سلولهای آلوده تایید شد.

روایی و پایایی پژوهش

نویسندگان به طور خاص اظهار داشتند که نمی توانند از شرایط جمع آوری یا بروز علائم کاملاً مطمئن باشند. اما در متن به نظر می رسد که گفته های قبلی آنها مبنی بر اینکه همه نمونه ها از موارد علامتی گزارش شده است که نمونه ها “از طیف وسیعی از سناریوها از جمله نظارت بر کارکنان مراقبت های بهداشتی و درمانی، افراد علامت دار به عنوان بخشی از پاسخ اپیدمی اولیه و نمونه های به دست آمده آزمایش شده اند، مغایرت دارند. در تحقیقات شیوع بیماری، انتخاب موارد بدون علامت از طریق ترشحات افراد در حال تماس و یا آزمایشگاه / خانواده / خانه بود.”

چه چیز دیگری را می بایست در نظر بگیرم؟

این مطالعه بخشی از شواهد در حال رشد است که ارتباط علائم را با مقادیر PCR و عفونت نشان می دهد.

منبع : cebm.net